
SMILES & InChI | 化学结构的线性表示法 - 知乎
SMILES表示法、SMARTS表示法和InChI表示法都是用少量字符表示结构信息的重要方法。 化合物的图表示 可以将一个分子视为一个以原子为节点,结合为边的图。图形可以表示一个原子 …
有没有哪个软件可以查找各种物质的化学结构式? - 知乎
PubChem 检索可得到的结果包含了分子式、SMILES、2D和3D结构、InChI和InChIKey、相对分子质量、脂水分配系数、氢键受体和供体数目、可旋转键数目、互变异构体数目等基本的结构信 …
机器学习做MD模拟时,分子的特征描述符指的是什么 ...
在上面这个示例里,我们将SMILES字符串“CCO”转化为一个长度为1024的位串(分子指纹),可以直接用作机器学习模型的输入特征。 简单总结一下: 分子的特征描述符是分子描述符在机 …
使用PubChem想搜索药物的SMILE只有药物名,能找到准确 ...
使用PubChem通过药物名搜索SMILES,通常可以找到准确的化学结构。 PubChem是一个非常全面的化学信息数据库,包含了大量的药物信息,包括药物名称、化学结构、SMILES、InChI等。
在线批量转化smile 到sdf: work smart - 知乎
Jul 9, 2021 · 这个脚本本身或者经过简单的修改可快速在线将众多smiles转化为对应的三纬结构,而无需在自己电脑安装任何软件。 在Colab或者本地Jupyter(或者百度AI)运行该脚本, …
有没有化学或者药学的同学,smiles一致但pubchem号不同 ...
Feb 28, 2022 · 有没有化学或者药学的同学,smiles一致但pubchem号不同的两物质属于一个物质吗? 正在做网络药理学,在数据库中搜到的成分,smiles一样,但是pubchem中属于两个物 …
求助网络药理学大神!? - 知乎
第二步: SwissADME 导入结构或者粘贴SMILES号,点击Run! 通过类药性五原则判断成分取舍。 第三步: SwissTargetPrediction 预测符合要求的成分靶点,输入SMILES号预测 2 …
请问,如何将化合物名称批量转化为化学式? - 知乎
请问,如何将化合物名称批量转化为化学式? 各位大佬好,我在本草组鉴数据库下载下来的多个活性成分的名称,想将其批量转化为smiles格式的一维结构,请问该如何做呢? 非常感谢! 显 …
干货丨化合物靶标预测平台工具盘点 - 知乎
Dec 15, 2020 · 使用方法: ①打开 网站主页:swisstargetprediction.ch ②在Select a species处选择物种,默认选择人; ③上传需要预测靶标的分子结构,可以以Smiles代码或在右侧窗口中 …
使用Python语言,smiles转化为2维分子图? - 知乎
# 定义SMILES字符串 smiles = "CCO" # 这里以乙醇的SMILES为例,你可以替换成你需要的 # 根据SMILES创建分子对象 mol = Chem.MolFromSmiles (smiles) # 设置原子颜色,这里创建一 …